Browsing by Author "Gül, Sümeyye Berfin"

Now showing 1 - 2 of 2

Bir Dizi Prodigiosin ve 1,10-fenantrolin Türevlerinin Yeni Nesil Etkin Antikanser Tedavi Edici İlaçlar Ya Da Aktif Farmasötik Maddeler Olarak Tasarımı ve Yapısal İncelenmesi
(2024) Çetin, M. Mustafa; Çetin, Muhammet Mustafa; Gül, Sümeyye Berfin
Meme kanseri, beyin metastazı olasılığı en yüksek olan ikinci kanser türü olarak kabul edilmektedir. Bu yüzden meme kanseriyle ilgili araştırmaların çoğu beyin metastatik meme kanserinin mortalitesine yöneliktir. Ancak bu kanser türüne özgü etkili bir tedavi veya antikanser tedavi yöntemi mevcut değildir. Bu nedenle, meme kanseri ilerlemesinin modüle edilmesinde çok önemli rol oynayan HDAC ve mTOR enzimlerini inhibe edecek etkili ve yeni nesil antikanser terapötik ilaçların ve/veya aktif farmasötik maddelerin geliştirilmesi artan bir taleptir. Bu çalışmada, mTOR ve HDAC enzimlerine karşı oldukça güçlü antikanser terapötik ilaçlar ve/veya aktif farmasötik maddeler olarak bir dizi prodigiosin ve 1,10-fenantrolin türevinin yapı-aktivite ilişkisi ve in silico modellemesi incelenmiştir. Doğal ürün Ps ile karşılaştırıldığında, bu ligandlardan 20 tanesi, özellikle 2a, 6b, 13 ve 13a, HDAC1 ve/veya mTOR enzimlerine karşı –9.4 ile –7.1 kcal/mol arasında değişen çok umut verici bağlanma enerjileri ve 225 ile 569 nM arasında değişen inhibisyon sabitleri sergilemiştir. Özellikle 2a, 5, 6b, 7b ve 13 her iki enzime karşı iki taraflı etkinlik (dual action) göstermiştir. İn silico modelleme çalışmalarından elde edilen bulgular, MD simülasyonları ve Lipinski'nin beş kuralına göre ADMET çalışmasıyla da desteklenmiş olup, meme kanseri beyin metastazına sahip hastalar için olağanüstü bir terapötik potansiyel sağlamaktadır.
Mtor ve Hdac1 Enzimlerine Karşı Yüksek Güçlü ve Etkili Yeni Antikanser Terapötik İlaçlar Olarak 1,10-fenantrolin ve Prodigiosin Türevleri Serisi
(2024) Gül, Sümeyye Berfin; Çetin, Muhammet Mustafa; Çetin, Muhammet Mustafa
Meme kanseri, beyin metastazı olasılığı en yüksek olan ikinci kanser türü olarak kabul edilmektedir. Ancak bu kanser türüne özgü etkili bir antikanser terapötik/tedavisi mevcut değildir. Bu nedenle, meme kanserinin ilerlemesinde hayati önem taşıyan mTOR ve HDAC enzimlerini inhibe eden yeni ve etkili antikanser terapötik ilaçların/API'lerin oluşturulmasına yönelik artan bir ihtiyaç vardır. Bu çalışma, mTOR ve HDAC enzimlerini hedef alan yeni ve oldukça güçlü antikanser terapötik ilaçlar/API'ler olarak bir dizi prodigiosin ve 1,10-fenantrolin türevlerinin yapı-aktivite ilişkisini ve in silico modellemesini incelemiştir. Oldukça güçlü ligandları tanımlamak için doğal ürün Ps ile karşılaştırmalı analiz yapılmıştır. Bu ligandların MD simülasyonları gerçekleştirilmiş ve MD simülasyonlarının yörüngesinden, ligand-enzim komplekslerinin yapısal konformasyonlarını, stabilitesini, esnekliğini/dalgalanmasını ve genel boyutlarını değerlendirmek için RMSD, RMSF ve Rg parametreleri hesaplanmıştır. Ek olarak, Lipinski'nin beş kuralı ile yapılan ADMET çalışması farmakolojik potansiyeli değerlendirmektedir. Doğal ürün Ps ile karşılaştırıldığında, oldukça güçlü ligandlardan 20'si, özellikle 2a, 6b, 13 ve 13a, HDAC1 ve/veya mTOR enzimlerine karşı, -9,4 ila -7,1 kcal/mol arasında değişen umut verici bağlanma enerjileri ve 225 ila 569 nM arasında değişen inhibisyon sabitleri sergiler. Özellikle, 2a, 5, 6b, 7b ve 13 numaralı ligandlar, her iki enzime karşı etkili ikili etki sergiler. Ayrıca ADMET çalışmasına göre, seçilen ligandların hiçbiri Lipinski'nin beş kriterli kuralından ikiden fazlasını ihlal etmedi; bu da farmakolojik olarak aktif olma potansiyelinin çok umut verici olduğunu gösterdi. Sonuç olarak, in silico hesaplamalı modellemeyi kullanarak, aynı zamanda beyin metastazı riski yüksek olan meme kanseri hastaları için olağanüstü terapötik potansiyel sunan belirli bileşikler elde ettik. Son derece umut verici sonuçlar nedeniyle, seçilmiş birkaç bileşiğin daha ileri sentezleri şu anda laboratuvarlarımızda araştırılmaktadır.