In silico design and modeling of peptidomimetic drug candidates for methionine aminopeptidase 2 enzyme for prevention of cancer
Abstract
Birçok hastalık bir araya gelerek kanseri oluşturur. Kanser hücreleri kontrolsüz bir şekilde bölünür. Kanserde hücre çoğalması anormaldir. Yıllar içinde 200'den fazla kanser çeşidi teşhis edilmiştir. Bazı faktörler kansere neden olabilir. Kalıtım, beslenme, hormonlar, sigara içme, alkol tüketimi, radyasyon, bazı kimyasallar, virüsler ve bakteriler bu faktörlerden birkaçıdır. 2018 yılında 17 milyon yeni kanser vakası ve 9.5 milyon kanser nedenli ölüm gözlenmiştir. Metiyonin aminopeptidaz (MetAP 2) kobalt içeren ve hücrenin sitozolünde bulunan bir metalloproteazdır. Bu enzim yeni sentezlenmiş proteinin amino kısmında bulunan metiyonin amino asidini proteinden ayırır. Ayrıca kanser tedavisinde anjiyojenezi önlemek için yeni peptidomimetik inhibitörler keşfedilmesinde bu enzim kullanılır. Peptidomimetikler peptitlerin işlev ve yapısını taklit etmek için dizayn edilir. Peptitlere göre peptidomimetikler daha yüksek biyoyararlılık ve daha az yan etki gösterir. Bu çalışmada, Discovery Studio adlı program kullanılarak peptidomimetik inhibitörler dizayn edilmiştir. Daha sonra hedef reseptör (MetAP 2) ve inhibitörler birbirlerine bağlanarak en iyi bağlanma modları bulunmuştur. Son olarak Gibbs serbest enerjisi ve ADMET özelliklerine bakılarak en iyi 10 peptidomimetik inhibitör seçilmiştir. MetAP 2 enzimine karşı dizayn edilen bu peptidomimetik inhibitörler yakın gelecekte ilaç dizaynında umut verici işler başaracaktır.
Collections
- Tez Koleksiyonu [1348]