Eroğlu, Deniz
Loading...
Profile URL
Name Variants
Deniz, Eroglu
Eroglu,D.
Eroğlu, DENIZ
DENIZ EROĞLU
Eroglu, Deniz
Eroglu D.
EROĞLU, DENIZ
Eroğlu,D.
Deniz EROĞLU
Eroğlu, D.
Eroğlu, Deniz
Deniz Eroğlu
E., Deniz
EROĞLU, Deniz
E.,Deniz
D. Eroğlu
Eroglu,Deniz
Eroğlu, Deniz
Eroglu,D.
Eroğlu, DENIZ
DENIZ EROĞLU
Eroglu, Deniz
Eroglu D.
EROĞLU, DENIZ
Eroğlu,D.
Deniz EROĞLU
Eroğlu, D.
Eroğlu, Deniz
Deniz Eroğlu
E., Deniz
EROĞLU, Deniz
E.,Deniz
D. Eroğlu
Eroglu,Deniz
Eroğlu, Deniz
Job Title
Dr. Öğr. Üyesi
Email Address
Main Affiliation
Molecular Biology and Genetics
Status
Current Staff
Website
ORCID ID
Scopus Author ID
Turkish CoHE Profile ID
Google Scholar ID
WoS Researcher ID
Sustainable Development Goals
4
QUALITY EDUCATION
0
Research Products
6
CLEAN WATER AND SANITATION
0
Research Products
10
REDUCED INEQUALITIES
0
Research Products
13
CLIMATE ACTION
1
Research Products
14
LIFE BELOW WATER
1
Research Products
2
ZERO HUNGER
0
Research Products
8
DECENT WORK AND ECONOMIC GROWTH
0
Research Products
12
RESPONSIBLE CONSUMPTION AND PRODUCTION
0
Research Products
9
INDUSTRY, INNOVATION AND INFRASTRUCTURE
1
Research Products
17
PARTNERSHIPS FOR THE GOALS
1
Research Products
1
NO POVERTY
0
Research Products
11
SUSTAINABLE CITIES AND COMMUNITIES
3
Research Products
15
LIFE ON LAND
0
Research Products
3
GOOD HEALTH AND WELL-BEING
2
Research Products
7
AFFORDABLE AND CLEAN ENERGY
0
Research Products
5
GENDER EQUALITY
0
Research Products
16
PEACE, JUSTICE AND STRONG INSTITUTIONS
0
Research Products
Documents
36
Citations
729
h-index
16
This researcher does not have a WoS ID.
Scholarly Output
27
Articles
21
Views / Downloads
2/0
Supervised MSc Theses
3
Supervised PhD Theses
3
WoS Citation Count
199
Scopus Citation Count
216
WoS h-index
8
Scopus h-index
8
Patents
0
Projects
0
WoS Citations per Publication
7.37
Scopus Citations per Publication
8.00
Open Access Source
20
Supervised Theses
6
| Journal | Count |
|---|---|
| Physical Review Research | 2 |
| Physical Review X | 2 |
| Earth Surface Processes and Landforms | 1 |
| Entropy | 1 |
| European Physical Journal-Special Topics | 1 |
Current Page: 1 / 4
Scopus Quartile Distribution
Competency Cloud
27 results
Scholarly Output Search Results
Now showing 1 - 10 of 27
Master Thesis Makroskopik Ağ Sistemlerinde Veri Odaklı Trafik Akışı Modellemesi(2025) Fırat, Toprak; Eroğlu, DenizKentsel trafik sıkışıklığı, günümüz şehirleri için süregelen, karmaşık ve yüksek maliyetli bir problemdir. Artan seyahat süreleri, çevresel bozulma, enerji israfı ve ekonomik kayıplar bu problemin doğrudan sonuçları arasında yer almaktadır. Bu sorunlarla etkili şekilde başa çıkabilmek yalnızca altyapı yatırımlarıyla değil; aynı zamanda ulaşım politikaları, trafik yönetimi ve kontrol sistemlerinin bilimsel temellerle tasarlanmasıyla mümkündür. Bu kapsamda, trafiğin zaman ve mekân içinde nasıl evrildiğine dair sistematik ve ölçeklenebilir bir anlayış geliştirmek kritik önem taşır. Gerçek dünyada yapılacak deneyler genellikle maliyetli, zaman alıcı ve bozucudur. Bu nedenle, kentsel trafik sistemlerinin modellenmesi; alternatif senaryoların test edilmesi, politika etkilerinin değerlendirilmesi ve uzun vadeli sonuçların öngörülebilmesi açısından vazgeçilmez bir araçtır. Bununla birlikte, mevcut trafik modelleme yaklaşımları önemli sınırlılıklar taşır. Mikroskobik modeller bireysel araç davranışlarını yüksek ayrıntıyla temsil etse de, büyük ağlarda hesaplama açısından verimsizdir ve yoğun kalibrasyon verisi gerektirir. Makroskobik modeller ise daha hesaplıdır; ancak sabit başlangıç-varış (OD) akışları, homojen yol davranışları ve sürekli akış varsayımları gibi sadeleştirici kabuller içerir. Bu da onları karmaşık ve heterojen şehir yapıları için yetersiz kılar. Bu tez, trafik akışını yönlü bir ağda ayrık zamanlı yük alışverişiyle temsil eden veri odaklı bir makroskobik model önermektedir. Yol türlerine özgü akış dinamikleri, ağ topolojisi ve gözlemlenen trafik yoğunlukları modele entegre edilerek darboğazlar, geri tepme ve yük yeniden dağılımı gibi olgular temsil edilmektedir. Model parametreleri, evrimsel optimizasyon yoluyla, örtük talep varsayımı olmadan veriden öğrenilmektedir. Model, klasik Hücresel İletim Modeli (CTM) ile karşılaştırılmış; SUMO simülasyonları ve İstanbul, Londra ile New York verileri üzerinde üstünlük göstermiştir.Article Citation - WoS: 8Citation - Scopus: 8Sampling Rate-Corrected Analysis of Irregularly Sampled Time Series(Amer Physical Soc, 2022) Braun, Tobias; Fernandez, Cinthya N.; Eroglu, Deniz; Hartland, Adam; Breitenbach, Sebastian F. M.; Marwan, NorbertThe analysis of irregularly sampled time series remains a challenging task requiring methods that account for continuous and abrupt changes of sampling resolution without introducing additional biases. The edit distance is an effective metric to quantitatively compare time series segments of unequal length by computing the cost of transforming one segment into the other. We show that transformation costs generally exhibit a nontrivial relationship with local sampling rate. If the sampling resolution undergoes strong variations, this effect impedes unbiased comparison between different time episodes. We study the impact of this effect on recurrence quantification analysis, a framework that is well suited for identifying regime shifts in nonlinear time series. A constrained randomization approach is put forward to correct for the biased recurrence quantification measures. This strategy involves the generation of a type of time series and time axis surrogates which we call sampling-rate-constrained (SRC) surrogates. We demonstrate the effectiveness of the proposed approach with a synthetic example and an irregularly sampled speleothem proxy record from Niue island in the central tropical Pacific. Application of the proposed correction scheme identifies a spurious transition that is solely imposed by an abrupt shift in sampling rate and uncovers periods of reduced seasonal rainfall predictability associated with enhanced El Nino-Southern Oscillation and tropical cyclone activity.Article Citation - WoS: 4Citation - Scopus: 7Collective dynamics of random Janus oscillator networks(AMER PHYSICAL SOC, 2020) Peron, Thomas; Eroğlu, Deniz; Rodrigues, Francisco A.; Moreno, YamirJanus oscillators have been recently introduced as a remarkably simple phase oscillator model that exhibits nontrivial dynamical patterns-such as chimeras, explosive transitions, and asymmetry-induced synchronization-that were once observed only in specifically tailored models. Here we study ensembles of Janus oscillators coupled on large homogeneous and heterogeneous networks. By virtue of the Ott-Antonsen reduction scheme, we find that the rich dynamics of Janus oscillators persists in the thermodynamic limit of random regular, Erdos-Renyi, and scale-free random networks. We uncover for all these networks the coexistence between partially synchronized states and a multitude of solutions of a collective state we denominate as a breathing standing wave, which displays global oscillations. Furthermore, abrupt transitions of the global and local order parameters are observed for all topologies considered. Interestingly, only for scale-free networks, it is found that states displaying global oscillations vanish in the thermodynamic limit.Article Fourier's Law Breakdown for the Planar-Rotor Chain with Long-Range Interactions(Elsevier, 2026) Lima, Henrique Santos; Tsallis, Constantino; Eroglu, Deniz; Tirnakli, UgurFourier's law, which linearly relates heat flux to the negative gradient of temperature, is a fundamental principle in thermal physics and widely applied across materials science and engineering. However, its validity in low-dimensional systems with long-range interactions remains only partially understood. We investigate here the thermal transport along a onedimensional chain of classical planar rotators with algebraically decaying interactions 1/ with distance ( >= 0), known as the inertial a-XY model. Using nonequilibrium simulations with thermal reservoirs at the boundaries, we numerically study the thermal conductance as a function of system sizea, temperature , and . We find that the results obey a universal scaling law characterized by a stretched-exponential function with -dependent parameters. Notably, a threshold at approximate to 2 separates two regimes: for >= , Fourier's law holds with size-independent conductivity = , while for < , anomalous transport is observed, corroborating (with higher precision) the results reported in Phys.Rev.E94,042117(2016). These findings provide a quantitative framework for understanding the breakdown of Fourier's law in systems with long-range interactions. The simulation is carried out by assuming the equations of motion, which include Langevin heat baths applied to the first and last particles, and are integrated using the Velocity Verlet algorithm. The conductance is calculated from the connection between Lagrangian heat flux and heat equation for typical values of (, , ). For large , the results can be collapsed into an universal -stretched exponential form, namely proportional to -() , where = [1 + (1-)]1/(1-). The parameters (, , ,) are -dependent, and is the index of the -stretched exponential. This form is achievable due to the ratio /( - 1) being almost constant with respect to the lattice size. These findings provide significant insights into heat conduction mechanisms in systems with long-range interactions.Article Data-Driven Modeling of Traffic Flow in Macroscopic Network Systems(AIP Publishing, 2025) Firat, Toprak; Eroglu, DenizUrban traffic modeling is essential for understanding and mitigating congestion, yet existing approaches face a trade-off between realism and scalability. Microscopic agent-based simulators capture individual vehicle behavior but are computationally intensive and hard to calibrate at scale. Macroscopic models, while more efficient, often rely on strong assumptions, such as fixed origin-destination flows, or oversimplify network dynamics. In this work, we propose a data-driven macroscopic model that simulates traffic as a discrete-time load-exchange process over flow networks. The model captures key phenomena such as bottlenecks, spillbacks, and adaptive load redistribution using only road-type attributes, network structure, and observed traffic density. Parameter learning is performed via evolutionary optimization, allowing the model to adapt to both synthetic and real-world conditions without assuming latent travel demand. We evaluate the framework on synthetic grid-like networks and on real traffic data from London, Istanbul, and New York. The resulting framework provides a scalable and interpretable alternative for urban traffic forecasting, balancing predictive accuracy with computational efficiency across diverse network conditions.Doctoral Thesis Paleoiklim Ağları: Oluşturulma ve Analiz(2025) Özdeş, Mehmet Çelik; Eroğlu, DenizDünya'nın iklimi, farklı ölçeklerde ve doğrusal olmayan etkileşimlerle karakterize edilen, karmaşık bir sistemdir ve küçük değişikliklerin ani rejim değişiklikleri veya dönüm noktaları gibi orantısız ve öngörülemez sonuçlara yol açabilmesi nedeniyle uzun vadeli tahmini zordur. İklimin geçmişindeki kritik geçişleri araştırmak son derece önemlidir çünkü bu tür ani, büyük ölçekli değişiklikler toplumlar ve doğal ekosistemler için derin ve geri döndürülemez sonuçlara sebep olabilir. Bu durum, olası felaket etkilerini hafifletmek için erken uyarı göstergelerinin ve adaptasyon stratejilerin geliştirilmesini gerekli kılar. Paleoiklim çalışmaları, ölçüm olarak düzen- siz aralıklı zaman serileri üreten, çeşitli fiziksel biçimlerde korunan vekil kayıtları kullanmaktadır. Bu tezde, düzensiz seriler için düzenli aralıklı temsilci serilerinden oluşan ve bir baz olarak işlev görecek, genişletilmiş bir analitik araç (Dönüşüm Maliyeti Spektrumu) geliştiril- miştir. Bu yaklaşım, birden fazla vekil ölçümünden gelen bilgiyi değerlendirmek için ortak bir zaman çizelgesinin oluşturulmasına olanak tanır ve verilerde gizli dinamik desenler hakkında spektral bilgi sağlar. Ardından, uzamsal vekil bilgileri aracılığıyla iklim rejimi değişikliklerini araştırmak için yöntem- sel bir çerçeve öneriyorum. İklim sistemindeki uzak-bağlantıları taklit eden veri odaklı kavramsal birimler (İşlevsel Etkileşim Ağları) kullanılarak çevre dinamiklerinin kaba bir tarifi yapılabilir. Bunların çevresel dinamik koşulları için yorumlanabilir ve temsili vekiller olduğunu ve geçiş yapılarının da sistemin davranışını karakterize edebilecek, sistemin yapısal kısıt- larının doğasını ortaya çıkarabilecek olduğunu gösteriyorum. Yöntemlerimi sentetik ve gerçek sistemlerde doğruladıktan sonra, önemli geçişlerin karakteristik özelliklerini ortaya çıkarmak için iklim tarihindeki iki dönemi analiz ediyorum. Bu bulgular, iklim sisteminin durumunu yorumlama ve kritik geçişlerini tahmin etme becerimize katkıda bulunmaktadır.Doctoral Thesis Fizik Tabanlı Elektrik Şebekesi Yeniden İnşası: Karmaşık Sistemler Perspektifi(2025) Rezaeinazhad, Arash Mohammadian; Eroğlu, DenizEnerji, modern yas¸amın tum y ¨ onlerini beslerken, elektrik s¸ebekesi bu sistemin temel ¨ altyapısını olus¸turur. Ancak bu s¸ebeke, buy¨ uk¨ olc¸ekli, do ¨ grusal olmayan ve mek ˘ ana ˆ gom¨ ul¨ u yapısıyla insan eliyle yapılmıs¸ en karmas¸ık sistemlerden biridir. K ¨ uc¸¨ uk bir bozul- ¨ ma bile ardıs¸ık arızaları tetikleyerek genis¸ c¸aplı elektrik kesintilerine ve toplumsal etkilere yol ac¸abilir. Gunes¸ ve r ¨ uzg ¨ ar gibi yenilenebilir kaynaklara gec¸is¸in hızlanmasıyla birlikte, ˆ s¸ebeke degis¸kenlik ve merkezsiz ˘ uretim gibi yeni zorluklarla kars¸ı kars¸ıyadır. Bu nedenle, ¨ s¸ebekenin kararlılıgını ve dayanıklılı ˘ gını sa ˘ glamak hem bilimsel bir zorunluluk hem de ˘ pratik bir ihtiyac¸ haline gelmis¸tir. ˆ Bu tez, karmas¸ık sistemler bakıs¸ ac¸ısıyla tasarlanmıs¸ ac¸ık kaynaklı bir yazılım hattı sunar. Bu hat, ac¸ık eris¸imli cografi verileri kullanarak y ˘ uksek gerilimli iletim a ¨ gı modelleri ˘ olus¸turmayı mumk ¨ un kılar. Y ¨ ontem genel olarak uygulanabilir olsa da, detaylı bir ¨ ornek ¨ c¸alıs¸ma olarak Turkiye elektrik iletim s¸ebekesi ele alınmıs¸tır. Ac¸ık eris¸imli, fiziksel olarak ¨ detaylı s¸ebeke modellerinin azlıgını gidermek amacıyla, OpenStreetMap verileri is¸lenerek ˘ MATLAB MATPOWER ile uyumlu modeller uretilmis¸tir. Ortaya c¸ıkan veri seti; hat ¨ empedansları, termal sınırlar ve yuk da ¨ gılımları gibi temel elektriksel parametreleri ic¸erir. ˘ Bu parametreler muhendislik tahminleriyle elde edilip g ¨ uc¸ akıs¸ı ac¸ısından do ¨ grulanmıs¸tır. ˘ ˙Iki ornek c¸alıs¸ma, yazılım aracının ve olus¸turulan veri setinin yararlılı ¨ gını g ˘ ostermektedir. ¨ ˙Ilk c¸alıs¸ma, senkronizasyon kararlılıgını, kararsızlı ˘ gın erken uyarı sinyallerini tespit et- ˘ mek ic¸in stokastik perturbasyon analizi kullanarak incelemektedir. ¨ ˙Ikinci c¸alıs¸ma ise termal as¸ırı yuklenmelere ba ¨ glı ardıs¸ık arızaları aras¸tırmakta, kırılgan iletim hatlarını belir- ˘ lemekte ve dayanıklılıgı artırmak ic¸in hedefe y ˘ onelik g ¨ uc¸lendirme ¨ onerileri sunmaktadır. ¨ Bu ornekler, elektrik s¸ebekesi dinamiklerini modellemede fiziksel ve yapısal gerc¸ekc¸ili ¨ gin ˘ onemini vurgulamaktadır. ¨ Bu c¸alıs¸maların otesinde, veri seti ve yazılım aracı, g ¨ uc¸ sistemi modellemesi ic¸in ¨ olc¸ekle- ¨ nebilir ve tekrarlanabilir bir c¸erc¸eve sunmaktadır. Yenilenebilir entegrasyonu, genis¸leme planlaması, dayanıklılık analizi ve gerc¸ek zamanlı izleme gibi uygulamaları desteklemektedir. Hem arac¸ların hem de verilerin kamuya ac¸ık hale getirilmesiyle, bu tez modern enerji altyapısının kararlılıgı ve s ˘ urd ¨ ur¨ ulebilirli ¨ gi˘ uzerine veri odaklı, disiplinlerarası ¨ aras¸tırmalara katkı saglamaktadır. ˘ Anahtar Sozcükler: Elektrik S¸ ebekesi Altyapısı, OpenStreetMap Veri Entegrasyonu, Karmas¸ık Sistemler Analizi, Senkronizasyon, KararlılıkArticle Citation - Scopus: 7Collective Dynamics of Random Janus Oscillator Networks(American Physical Society, 2020) Peron,T.; Eroglu,D.; Rodrigues,F.A.; Moreno,Y.Janus oscillators have been recently introduced as a remarkably simple phase oscillator model that exhibits nontrivial dynamical patterns-such as chimeras, explosive transitions, and asymmetry-induced synchronization-that were once observed only in specifically tailored models. Here we study ensembles of Janus oscillators coupled on large homogeneous and heterogeneous networks. By virtue of the Ott-Antonsen reduction scheme, we find that the rich dynamics of Janus oscillators persists in the thermodynamic limit of random regular, Erdos-Rényi, and scale-free random networks. We uncover for all these networks the coexistence between partially synchronized states and a multitude of solutions of a collective state we denominate as a breathing standing wave, which displays global oscillations. Furthermore, abrupt transitions of the global and local order parameters are observed for all topologies considered. Interestingly, only for scale-free networks, it is found that states displaying global oscillations vanish in the thermodynamic limit. © 2020 authors. Published by the American Physical Society.Article Citation - WoS: 4Citation - Scopus: 4First-Principle Validation of Fourier's Law in D=1, 2, 3 Classical Systems(Elsevier, 2023) Tsallis, Constantino; Lima, Henrique Santos; Tirnakli, Ugur; Eroglu, DenizWe numerically study the thermal transport in the classical inertial nearest-neighbor XY ferromagnet in d = 1, 2, 3, the total number of sites being given by N = Ld, where L is the linear size of the system. For the thermal conductance sigma, we obtain sigma(T, L)L delta(d)= A(d) e-B(d) [L gamma (d)T ]eta(d) (with ez q(d) q equivalent to [1+(1-q)z]1/(1-q); ez1 = ez; A(d) > 0; B(d) > 0; q(d) > 1; eta(d) > 2; delta >= 0; gamma(d) > 0), for all values of L gamma(d)T for d = 1, 2, 3. In the L -> infinity limit, we have sigma proportional to 1/L rho sigma(d) with rho sigma(d) = delta(d)+gamma(d)eta(d)/[q(d)-1]. The material conductivity is given by kappa = sigma Ld proportional to 1/L rho kappa(d) (L -> infinity) with rho kappa(d) = rho sigma(d) - d. Our numerical results are consistent with 'conspiratory' d-dependences of (q, eta, delta, gamma), which comply with normal thermal conductivity (Fourier law) for all dimensions.(c) 2023 Published by Elsevier B.V.Article Forecasting Critical Economic & Political Events Via Electricity Consumption Patterns in the United States of America and Turkey(Springernature, 2025) Ozdes, Celik; Ediger, Volkan S.; Eroglu, DenizImpacts from natural disasters, government decisions and public's reactions can significantly alter societal daily routines. These effects resonate in systems where individual contributions, such as energy consumption, serve as indirect indicators of societal welfare and living standards. Preparedness for unforeseen events is crucial to enhancing societal well-being. Thus, analysing historical data for unexpected critical transitions and forecasting future occurrences is paramount. Recurrence properties of gross monthly electricity consumption in the United States of America and Turkey are examined, revealing coinciding critical periods with extreme regimes identified by a determinism time series. An ensemble of neural network proxies is then employed to forecast critical periods within a limited time frame, enabling the anticipation of similar occurrences. Validation of this approach demonstrates high predictive performance when measured quantities adequately reflect underlying system dynamics. Predictions based on electricity consumption data suggest potential systemic and socioeconomic crises for both nations within one year, with probabilities, 85% for the US and 32% for Turkey.
- «
- 1 (current)
- 2
- 3
- »